Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPC1P35052 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPC1P35052 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPC1P35052 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPC1P35052 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPC1P35052 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPC1P35052 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPC1P35052 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms