Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 EFR3YMR212C 2349 nt2.16□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YGR265WYGR265W 411 nt2.16□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YJL015CYJL015C 285 nt2.16□□□□□ -2.06
NIC96P34077 HTB2YBL002W 396 nt2.16□□□□□ -2.06
NIC96P34077 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.16□□□□□ -2.06
NIC96P34077 SAR1YPL218W 573 nt2.16□□□□□ -2.06
NIC96P34077 YMR045CYMR045C 5268 nt2.16□□□□□ -2.06
NIC96P34077 MSB1YOR188W 3414 nt2.15□□□□□ -2.06
NIC96P34077 HCS1YKL017C 2052 nt2.15□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YDL118WYDL118W 381 nt2.15□□□□□ -2.07
NIC96P34077 CYC7YEL039C 342 nt2.15□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.15□□□□□ -2.07
NIC96P34077 snR43snR43 209 nt2.15□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YGR250CYGR250C 2346 nt2.15□□□□□ -2.07
NIC96P34077 NUP170YBL079W 4509 nt2.15□□□□□ -2.07
NIC96P34077 CFT2YLR115W 2580 nt2.14□□□□□ -2.07
NIC96P34077 EMP24YGL200C 612 nt2.14□□□□□ -2.07
NIC96P34077 USO1YDL058W 5373 nt2.14□□□□□ -2.07
NIC96P34077 CTR9YOL145C 3234 nt2.14□□□□□ -2.07
NIC96P34077 SEY1YOR165W 2331 nt2.14□□□□□ -2.07
NIC96P34077 ZRG17YNR039C 1818 nt2.14□□□□□ -2.07
NIC96P34077 SEC63YOR254C 1992 nt2.14□□□□□ -2.07
NIC96P34077 NOP53YPL146C 1368 nt2.13□□□□□ -2.07
NIC96P34077 ALG13YGL047W 609 nt2.13□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YGR069WYGR069W 336 nt2.13□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.13□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YCL046WYCL046W 324 nt2.13□□□□□ -2.07
NIC96P34077 MGA2YIR033W 3342 nt2.13□□□□□ -2.07
NIC96P34077 MSC6YOR354C 2079 nt2.13□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.12□□□□□ -2.07
NIC96P34077 DBP6YNR038W 1890 nt2.12□□□□□ -2.07
NIC96P34077 MAK10YEL053C 2202 nt2.12□□□□□ -2.07
NIC96P34077 SPG3YDR504C 384 nt2.12□□□□□ -2.07
NIC96P34077 UBP2YOR124C 3819 nt2.12□□□□□ -2.07
NIC96P34077 NUT2YPR168W 474 nt2.12□□□□□ -2.07
NIC96P34077 snR80snR80 171 nt2.11□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YIL102CYIL102C 306 nt2.11□□□□□ -2.07
NIC96P34077 JLP2YMR132C 627 nt2.11□□□□□ -2.07
NIC96P34077 IRE1YHR079C 3348 nt2.11□□□□□ -2.07
NIC96P34077 LYS14YDR034C 2373 nt2.1□□□□□ -2.07
NIC96P34077 BPH1YCR032W 6504 nt2.1□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YDR344CYDR344C 444 nt2.1□□□□□ -2.07
NIC96P34077 DCP2YNL118C 2913 nt2.1□□□□□ -2.07
NIC96P34077 MSH6YDR097C 3729 nt2.09□□□□□ -2.07
NIC96P34077 RFX1YLR176C 2436 nt2.09□□□□□ -2.07
NIC96P34077 MSH5YDL154W 2706 nt2.09□□□□□ -2.07
NIC96P34077 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.09□□□□□ -2.07
NIC96P34077 SLY1YDR189W 2001 nt2.08□□□□□ -2.08
NIC96P34077 RLM1YPL089C 2031 nt2.08□□□□□ -2.08
NIC96P34077 SPP41YDR464W 4308 nt2.08□□□□□ -2.08
NIC96P34077 SEC31YDL195W 3822 nt2.08□□□□□ -2.08
NIC96P34077 RPL38YLR325C 237 nt2.08□□□□□ -2.08
NIC96P34077 KOG1YHR186C 4674 nt2.08□□□□□ -2.08
NIC96P34077 ELG1YOR144C 2376 nt2.08□□□□□ -2.08
NIC96P34077 RIM20YOR275C 1986 nt2.07□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.07□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YIL032CYIL032C 357 nt2.07□□□□□ -2.08
NIC96P34077 ZIP1YDR285W 2628 nt2.07□□□□□ -2.08
NIC96P34077 MUK1YPL070W 1839 nt2.07□□□□□ -2.08
NIC96P34077 RAD61YDR014W 1944 nt2.07□□□□□ -2.08
NIC96P34077 HMI1YOL095C 2121 nt2.06□□□□□ -2.08
NIC96P34077 HIR3YJR140C 4947 nt2.06□□□□□ -2.08
NIC96P34077 MYO4YAL029C 4416 nt2.06□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YDL211CYDL211C 1119 nt2.06□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.06□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.06□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.06□□□□□ -2.08
NIC96P34077 SAP190YKR028W 3102 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 NPC2YDL046W 522 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 VTC1YER072W 390 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 TRX1YLR043C 312 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 UPS1YLR193C 528 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 TMA7YLR262C-A 195 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 REV3YPL167C 4515 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 MVP1YMR004W 1536 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 MDM20YOL076W 2391 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YLL032CYLL032C 2478 nt2.05□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YGL041CYGL041C 204 nt2.04□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YPP1YGR198W 2454 nt2.04□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YJR039WYJR039W 3366 nt2.04□□□□□ -2.08
NIC96P34077 AGC1YPR021C 2709 nt2.04□□□□□ -2.08
NIC96P34077 UBR2YLR024C 5619 nt2.04□□□□□ -2.08
NIC96P34077 FRK1YPL141C 2598 nt2.04□□□□□ -2.08
NIC96P34077 APL5YPL195W 2799 nt2.03□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.03□□□□□ -2.08
NIC96P34077 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.03□□□□□ -2.08
NIC96P34077 SAC3YDR159W 3906 nt2.02□□□□□ -2.09
NIC96P34077 PCC1YKR095W-A 267 nt2.02□□□□□ -2.09
NIC96P34077 DGR1YNL130C-A 147 nt2.02□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YPR063CYPR063C 423 nt2.02□□□□□ -2.09
NIC96P34077 COG8YML071C 1824 nt2.02□□□□□ -2.09
NIC96P34077 HSL1YKL101W 4557 nt2.02□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YFR016CYFR016C 3702 nt2.02□□□□□ -2.09
NIC96P34077 MLH3YPL164C 2148 nt2.02□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YDR426CYDR426C 378 nt2.01□□□□□ -2.09
NIC96P34077 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.01□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YHL042WYHL042W 453 nt2.01□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YLR255CYLR255C 354 nt2.01□□□□□ -2.09
NIC96P34077 snR49snR49 165 nt2.01□□□□□ -2.09
NIC96P34077 TFC3YAL001C 3483 nt2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.6 ms