Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms