Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC3AP31941 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.9 ms