Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASQ1P31415 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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