Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms