Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC8P31273 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC8P31273 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms