Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND3P30281 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND3P30281 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND3P30281 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND3P30281 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND3P30281 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND3P30281 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND3P30281 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND3P30281 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND3P30281 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND3P30281 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND3P30281 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND3P30281 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms