Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMBRP28336 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBRP28336 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBRP28336 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBRP28336 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBRP28336 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms