Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCD3P28288 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms