Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK3P27448 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK3P27448 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK3P27448 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK3P27448 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK3P27448 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK3P27448 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK3P27448 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK3P27448 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK3P27448 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK3P27448 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms