Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLNP26678 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLNP26678 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLNP26678 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLNP26678 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLNP26678 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLNP26678 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLNP26678 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLNP26678 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms