Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA3P26006 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms