Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2AP24928 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms