Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGA6P23229 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms