Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCP2P22307 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCP2P22307 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCP2P22307 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCP2P22307 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCP2P22307 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCP2P22307 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCP2P22307 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms