Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1P21675 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1P21675 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1P21675 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1P21675 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1P21675 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1P21675 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1P21675 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1P21675 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1P21675 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1P21675 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1P21675 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1P21675 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1P21675 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1P21675 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1P21675 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1P21675 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1P21675 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1P21675 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1P21675 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1P21675 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1P21675 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1P21675 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1P21675 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms