Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms