Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms