Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF3P18847 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF3P18847 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF3P18847 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF3P18847 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF3P18847 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF3P18847 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF3P18847 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF3P18847 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF3P18847 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATF3P18847 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF3P18847 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF3P18847 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF3P18847 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF3P18847 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF3P18847 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF3P18847 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF3P18847 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF3P18847 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF3P18847 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF3P18847 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF3P18847 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF3P18847 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF3P18847 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF3P18847 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF3P18847 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATF3P18847 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms