Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL17P18621 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL17P18621 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL17P18621 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL17P18621 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL17P18621 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL17P18621 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL17P18621 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL17P18621 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms