Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRAP18433 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRAP18433 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRAP18433 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms