Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR1P18146 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR1P18146 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR1P18146 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR1P18146 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR1P18146 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR1P18146 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EGR1P18146 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms