Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7P17544 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7P17544 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF7P17544 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF7P17544 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF7P17544 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF7P17544 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF7P17544 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF7P17544 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms