Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD1P17405 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms