Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZKSCAN1P17029 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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