Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CPEP16870 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPEP16870 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPEP16870 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPEP16870 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPEP16870 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPEP16870 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPEP16870 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CPEP16870 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CPEP16870 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPEP16870 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPEP16870 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPEP16870 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPEP16870 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms