Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTLA4P16410 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTLA4P16410 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms