Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD46P15529 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD46P15529 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD46P15529 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD46P15529 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD46P15529 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CD46P15529 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms