Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB1P14653 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms