Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms