Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41P11171 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41P11171 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41P11171 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41P11171 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41P11171 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41P11171 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41P11171 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41P11171 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41P11171 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41P11171 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41P11171 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41P11171 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41P11171 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41P11171 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms