Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CALM1P0DP23 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALM1P0DP23 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms