Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
U2AF1L5P0DN76 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms