Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC166P0CW27 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms