Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms