Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms