Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFMP07197 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFMP07197 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFMP07197 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFMP07197 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFMP07197 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFMP07197 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFMP07197 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEFMP07197 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEFMP07197 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFMP07197 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEFMP07197 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFMP07197 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFMP07197 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFMP07197 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFMP07197 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEFMP07197 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEFMP07197 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEFMP07197 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms