Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTNP04004 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTNP04004 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTNP04004 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VTNP04004 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VTNP04004 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTNP04004 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTNP04004 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTNP04004 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTNP04004 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTNP04004 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTNP04004 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTNP04004 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms