Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRBV12-3P01733 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms