Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD3O95983 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD3O95983 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD3O95983 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD3O95983 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD3O95983 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD3O95983 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD3O95983 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms