Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1O95476 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms