Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB6O95452 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB6O95452 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB6O95452 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB6O95452 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB6O95452 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB6O95452 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB6O95452 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB6O95452 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB6O95452 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB6O95452 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms