Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5LO95447 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms