Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC2O95347 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC2O95347 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC2O95347 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC2O95347 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC2O95347 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC2O95347 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC2O95347 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC2O95347 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms