Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLSTN1O94985 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSTN1O94985 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms