Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRMUO75648 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRMUO75648 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMUO75648 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMUO75648 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMUO75648 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMUO75648 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRMUO75648 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMUO75648 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMUO75648 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMUO75648 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMUO75648 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMUO75648 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMUO75648 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMUO75648 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRMUO75648 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRMUO75648 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms