Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms