Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC45O75419 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC45O75419 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC45O75419 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC45O75419 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC45O75419 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC45O75419 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC45O75419 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC45O75419 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC45O75419 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms