Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSO75390 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSO75390 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSO75390 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSO75390 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSO75390 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSO75390 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSO75390 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSO75390 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSO75390 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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